進一步處理難降解的有機物、氮和磷等能夠導致水體富營養化的可溶性無機物等。實驗室廢水處理設備主要方法有生物脫氮除磷法，混凝沉淀法，砂濾法，活性炭吸附法，離子交換法和電滲析法等。實驗室污水主要來自各科研單位實驗研究室和高等院校的科研和教學實驗室。實驗室廢水有其自身的特殊性質, 量少, 間斷性強, 高危害, 成分復雜多變。

 要解決實驗室污水怎么處理的問題，首先應了解其性質及特點。

   根據廢水中所含主要污染物性質, 可以分為實驗室有機和無機廢水兩大類。無機廢水主要含有重金屬、重金屬絡合物、酸堿、硫化物、鹵素離子以及其他無機離子等。有機廢水含有常用的有機溶劑、有機酸、醚類、多氯聯苯、有機磷化合物、酚類、石油類、油脂類物質。相比而言, 有機廢水比無機廢水污染的范圍更廣, 帶來的危害更嚴重。不同的廢水, 污染物組成不同, 處理方法和程度也不相同。實驗室污水的處理本著分類收集, 就地、及時地原位處理, 簡易操作, 以廢治廢和降低成本的原則。
目前, 還未見報道有成熟的工藝和方法能將實驗室污水綜合處理到達標排放的標準。
   需氧處理法目前常用的有活性污泥法、生物濾池和氧化塘等。厭氧處理法，又名生物還原處理法，主要用于處理高濃度有機廢水和污泥，使用處理設備，主要為消化池等。廢水處理設備針對產業廢水處理的難題，“十二五”產業廢水管理需要新思路，單純末端管理已經不能經濟地實現污染控制目標，需要從淘汰落后、清潔出產、過程控制等多個方面入手。這是圍繞產業廢水處理思索的一個方向，而另一個思路是，產業廢水處理項目確實存在未達到經濟運營規模及非專業化運營題目，導致項目運行本錢普遍偏高，廢水處理舉措措施未能施展其佳效能。臨床醫學實驗室和基礎醫學實驗室外排廢水污染負荷及允許排放標準，按污染程度分類實驗廢水按污染程度可分為高濃度實驗廢水、低濃度實驗廢水和無污染水等。高濃度實驗廢水包括一般液態失效試劑(廢鉻酸洗液,廢溶液等),液態實驗遺棄產物和中間產物(樣品分析殘液、各種有機溶劑、離心液、液體產品和副產品等),各種洗滌液(實驗后的洗滌液,產物或中間產物的高濃度洗滌液、儀器或器皿的潤洗液和高濃度洗滌廢水等)。

      實驗室污水的治理不能等同于工業污水處理,而是采用多單元處理流程系統或是有針對性地進行分類處理, 盡可能地降低處理難度, 使處理費用較低, 操作比較簡單。實驗室有機廢水處理方法可以借鑒其它有機廢水的處理。一般來說有機廢水處理技術主要包括生物法和物化法。對有機物濃度高、毒性強、水質水量不穩定的實驗室廢水, 生物法處理效果不佳, 而物化法對此類廢水的處理表現出明顯的優勢。實驗藥品回收、對實驗室廢棄物進行分類處理及回收循環再利用, 不僅能減小對環境的污染, 而且能減少化學藥品的浪費。對高濃度實驗室有機廢水, 將其中的有機溶劑如醇類、酯類、有機酸、酮及醚等回收循環使用后, 再用化學方法處理; 對濃度高、毒性大且無法回收的有機廢水, 需要進行集中焚燒處理。